基因数据处理19之BWA匹配算法串产生、匹配、评价等整体流程
环境: ubunut BWA samtools wgsim bwa.kit工具 1.数据下载:需要在bwa.kit下 bwa.kit/run-gen-ref hs38DH 2.串产生: hadoop@Mcnode1:~/cloud/adam/xubo/data/hs38DH$ wgsim -N 1000 -1 10 hs38DH.fa span style=”font-family: Arial,Helvetica,sans-seri
基因数据处理18之基因序列生成工具wgsim安装和使用
副标题#e# 1.下载: https://github.com/lh3/wgsim 可以git或者zip 2.安装: gcc -g -O2 -Wall -o wgsim wgsim.c -lz -lm 3.数据下载:可以使用bwakit下载: https://github.com/lh3/bwa/tree/master/bwakit 下载: bwa.kit/run-gen-ref hs38DH 4.使用方法
全基因组检测分析平台将疑似病例基因认识缩至半小时
浙江省疾控中心于2月1日上线自动化的全基因组检测分析平台,浙江全基因组检测分析平台由浙江省疾病预防控制中心、阿里达摩院医疗AI团队和杰毅生物技术公司共同研发。浙江省疾控中心基因测序负责人孙逸博士介绍说,这个平台基于阿里云的强大算力与达摩院新算